(資料圖片僅供參考)
近日,廣東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜研究所葉菜豆類資源與育種團隊聯(lián)合中山大學(xué)、浙江省農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜研究所在長豇豆基因組研究方面取得新進展。他們完成了長豇豆接近完整的基因組組裝,并率先克隆了豇豆莢花青素合成的關(guān)鍵基因。相關(guān)研究論文發(fā)表于Plant Biotechnology Journal。楊易和吳志坤為該論文共同第一作者,張艷為通訊作者。
長豇豆是一種重要豆類蔬菜,被譽為亞洲十大栽培蔬菜之一,中國是世界上長豇豆最大的種植和消費國。目前現(xiàn)有長豇豆基因組仍存在一定數(shù)量的間隙和未定位序列,這給功能基因組學(xué)研究帶來挑戰(zhàn)。作為果菜類蔬菜,外觀和營養(yǎng)是重要的品質(zhì)性狀,花青素賦予植物絢麗色彩的同時亦有保健功效,然而,調(diào)控豇豆莢花青素積累的關(guān)鍵基因仍然未知。
該研究綜合利用多種平臺的測序數(shù)據(jù),組裝完成了長豇豆豐產(chǎn)6號接近完整的基因組,解鎖了豇豆基因組中結(jié)構(gòu)最為復(fù)雜的著絲粒區(qū)域、端粒區(qū)域及大片段重復(fù)序列等,這是目前最完整的豇豆基因組。同時綜合利用該基因組和大規(guī)模轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),成功鑒定出一個控制長豇豆豆莢色澤的關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子基因VuMYB114,并進行功能驗證。
該研究發(fā)現(xiàn)為闡明長豇豆花青素代謝途徑的精細調(diào)控機制,以及未來設(shè)計育種提高豆莢的外觀及營養(yǎng)價值奠定了基礎(chǔ),是豇豆基因組學(xué)研究的重大突破,為豇豆研究領(lǐng)域提供了新的有力工具和重要理論基礎(chǔ)。
上述研究得到廣東省自然科學(xué)基金、廣東省重點領(lǐng)域研發(fā)計劃項目和廣東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院創(chuàng)新基金等項目的資助。
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